Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMF1P82094 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMF1P82094 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMF1P82094 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMF1P82094 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMF1P82094 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMF1P82094 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMF1P82094 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMF1P82094 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMF1P82094 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMF1P82094 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMF1P82094 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMF1P82094 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMF1P82094 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TMF1P82094 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMF1P82094 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMF1P82094 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMF1P82094 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TMF1P82094 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMF1P82094 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMF1P82094 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMF1P82094 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMF1P82094 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMF1P82094 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMF1P82094 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMF1P82094 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMF1P82094 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMF1P82094 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMF1P82094 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMF1P82094 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMF1P82094 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMF1P82094 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMF1P82094 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMF1P82094 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms