Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIM1P81133 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIM1P81133 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIM1P81133 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIM1P81133 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIM1P81133 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SIM1P81133 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SIM1P81133 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIM1P81133 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIM1P81133 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIM1P81133 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIM1P81133 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIM1P81133 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIM1P81133 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIM1P81133 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SIM1P81133 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIM1P81133 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIM1P81133 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIM1P81133 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIM1P81133 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIM1P81133 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIM1P81133 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIM1P81133 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIM1P81133 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIM1P81133 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIM1P81133 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SIM1P81133 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SIM1P81133 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIM1P81133 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SIM1P81133 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SIM1P81133 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SIM1P81133 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SIM1P81133 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SIM1P81133 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SIM1P81133 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIM1P81133 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIM1P81133 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SIM1P81133 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms