Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL20P78556 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL20P78556 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CCL20P78556 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL20P78556 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL20P78556 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL20P78556 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL20P78556 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL20P78556 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL20P78556 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL20P78556 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL20P78556 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL20P78556 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL20P78556 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL20P78556 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL20P78556 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL20P78556 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL20P78556 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL20P78556 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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