Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSNK2BP67870 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2BP67870 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms