Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTXN1P60606 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms