Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFRD-1P60508 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms