Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP107P57740 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP107P57740 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP107P57740 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP107P57740 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms