Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF3P57682 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF3P57682 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF3P57682 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF3P57682 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF3P57682 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF3P57682 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF3P57682 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF3P57682 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF3P57682 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF3P57682 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF3P57682 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms