Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTBP2P56545 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTBP2P56545 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms