Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTEP56180 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTEP56180 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTEP56180 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPTEP56180 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TPTEP56180 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TPTEP56180 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TPTEP56180 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TPTEP56180 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TPTEP56180 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TPTEP56180 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TPTEP56180 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms