Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAG2P55895 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAG2P55895 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAG2P55895 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAG2P55895 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAG2P55895 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms