Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP9P55211 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP9P55211 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP9P55211 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CASP9P55211 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASP9P55211 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms