Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB3P54284 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms