Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARSP54136 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RARSP54136 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARSP54136 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARSP54136 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARSP54136 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARSP54136 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARSP54136 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARSP54136 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARSP54136 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARSP54136 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARSP54136 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARSP54136 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARSP54136 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARSP54136 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARSP54136 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARSP54136 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARSP54136 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARSP54136 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RARSP54136 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARSP54136 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARSP54136 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARSP54136 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARSP54136 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARSP54136 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARSP54136 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARSP54136 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARSP54136 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARSP54136 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARSP54136 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARSP54136 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARSP54136 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARSP54136 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARSP54136 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARSP54136 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARSP54136 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RARSP54136 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARSP54136 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARSP54136 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARSP54136 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RARSP54136 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARSP54136 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARSP54136 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARSP54136 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARSP54136 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARSP54136 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARSP54136 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARSP54136 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARSP54136 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARSP54136 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARSP54136 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARSP54136 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARSP54136 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARSP54136 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARSP54136 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARSP54136 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARSP54136 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARSP54136 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARSP54136 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARSP54136 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARSP54136 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARSP54136 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARSP54136 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms