Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA3P52797 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms