Protein–RNA interactions for Protein: P51911

CNN1, Calponin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN1P51911 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNN1P51911 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNN1P51911 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNN1P51911 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNN1P51911 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNN1P51911 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNN1P51911 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNN1P51911 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNN1P51911 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNN1P51911 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNN1P51911 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN1P51911 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms