Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF6P49848 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF6P49848 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF6P49848 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF6P49848 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF6P49848 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF6P49848 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF6P49848 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF6P49848 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF6P49848 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF6P49848 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TAF6P49848 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TAF6P49848 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF6P49848 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF6P49848 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF6P49848 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF6P49848 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF6P49848 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF6P49848 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF6P49848 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF6P49848 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF6P49848 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF6P49848 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF6P49848 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF6P49848 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF6P49848 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF6P49848 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF6P49848 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF6P49848 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF6P49848 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF6P49848 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms