Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRIM1P49642 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms