Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GCLMP48507 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GCLMP48507 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GCLMP48507 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCLMP48507 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GCLMP48507 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCLMP48507 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCLMP48507 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCLMP48507 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCLMP48507 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCLMP48507 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCLMP48507 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCLMP48507 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCLMP48507 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCLMP48507 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GCLMP48507 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCLMP48507 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCLMP48507 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCLMP48507 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCLMP48507 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLMP48507 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLMP48507 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLMP48507 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLMP48507 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLMP48507 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLMP48507 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLMP48507 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLMP48507 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLMP48507 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLMP48507 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLMP48507 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLMP48507 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms