Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEDD4P46934 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms