Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSBP45954 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms