Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP3P42574 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP3P42574 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP3P42574 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP3P42574 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP3P42574 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP3P42574 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP3P42574 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP3P42574 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP3P42574 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP3P42574 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP3P42574 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP3P42574 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CASP3P42574 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASP3P42574 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASP3P42574 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASP3P42574 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP3P42574 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP3P42574 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP3P42574 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASP3P42574 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms