Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC1P41238 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms