Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPHP41219 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPHP41219 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPHP41219 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPHP41219 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPHP41219 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPHP41219 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPHP41219 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPHP41219 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPHP41219 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPHP41219 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPHP41219 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPHP41219 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPHP41219 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPHP41219 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms