Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRS3P32247 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRS3P32247 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRS3P32247 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRS3P32247 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRS3P32247 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRS3P32247 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BRS3P32247 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRS3P32247 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms