Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXC12P31275 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms