Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA5P30532 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA5P30532 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms