Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LTKP29376 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTKP29376 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTKP29376 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTKP29376 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTKP29376 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTKP29376 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTKP29376 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTKP29376 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LTKP29376 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTKP29376 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTKP29376 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTKP29376 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTKP29376 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LTKP29376 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTKP29376 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTKP29376 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTKP29376 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTKP29376 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTKP29376 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTKP29376 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LTKP29376 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTKP29376 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTKP29376 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTKP29376 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTKP29376 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTKP29376 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTKP29376 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LTKP29376 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LTKP29376 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LTKP29376 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LTKP29376 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LTKP29376 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTKP29376 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTKP29376 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTKP29376 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTKP29376 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTKP29376 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTKP29376 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LTKP29376 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTKP29376 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTKP29376 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LTKP29376 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTKP29376 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTKP29376 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTKP29376 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTKP29376 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTKP29376 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTKP29376 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTKP29376 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LTKP29376 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LTKP29376 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTKP29376 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTKP29376 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTKP29376 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTKP29376 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTKP29376 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTKP29376 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTKP29376 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTKP29376 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTKP29376 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms