Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR2AP28223 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HTR2AP28223 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms