Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNMT1P26358 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DNMT1P26358 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms