Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASTP20810 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASTP20810 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASTP20810 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASTP20810 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASTP20810 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASTP20810 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASTP20810 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASTP20810 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASTP20810 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASTP20810 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASTP20810 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASTP20810 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASTP20810 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASTP20810 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASTP20810 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASTP20810 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASTP20810 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASTP20810 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASTP20810 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASTP20810 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASTP20810 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASTP20810 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASTP20810 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASTP20810 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASTP20810 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASTP20810 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASTP20810 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASTP20810 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASTP20810 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASTP20810 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASTP20810 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASTP20810 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms