Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB5AP20339 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms