Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM21P19474 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM21P19474 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms