Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD53P19397 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD53P19397 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD53P19397 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CD53P19397 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD53P19397 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD53P19397 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms