Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA1P14867 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms