Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRF1P14222 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRF1P14222 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRF1P14222 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRF1P14222 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRF1P14222 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRF1P14222 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRF1P14222 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRF1P14222 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRF1P14222 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRF1P14222 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRF1P14222 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRF1P14222 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRF1P14222 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRF1P14222 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRF1P14222 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRF1P14222 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRF1P14222 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRF1P14222 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRF1P14222 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRF1P14222 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRF1P14222 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRF1P14222 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRF1P14222 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRF1P14222 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRF1P14222 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRF1P14222 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRF1P14222 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms