Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA4P13612 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA4P13612 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms