Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IFITM1P13164 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IFITM1P13164 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms