Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNB1P11230 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB1P11230 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms