Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms