Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL3P10147 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL3P10147 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL3P10147 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL3P10147 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL3P10147 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL3P10147 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL3P10147 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL3P10147 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL3P10147 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL3P10147 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3P10147 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3P10147 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3P10147 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3P10147 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3P10147 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3P10147 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3P10147 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3P10147 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3P10147 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3P10147 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3P10147 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL3P10147 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms