Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HKR1P10072 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HKR1P10072 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HKR1P10072 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HKR1P10072 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HKR1P10072 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HKR1P10072 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HKR1P10072 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HKR1P10072 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HKR1P10072 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HKR1P10072 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms