Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB1P08238 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB1P08238 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms