Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13BP05160 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13BP05160 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13BP05160 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13BP05160 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13BP05160 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13BP05160 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13BP05160 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
F13BP05160 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
F13BP05160 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
F13BP05160 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
F13BP05160 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
F13BP05160 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
F13BP05160 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
F13BP05160 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
F13BP05160 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
F13BP05160 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
F13BP05160 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms