Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTA1P02549 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms