Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
F13A1P00488 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
F13A1P00488 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
F13A1P00488 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
F13A1P00488 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
F13A1P00488 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
F13A1P00488 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
F13A1P00488 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
F13A1P00488 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
F13A1P00488 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
F13A1P00488 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
F13A1P00488 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
F13A1P00488 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms