Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MBD3O95983 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MBD3O95983 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3O95983 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3O95983 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3O95983 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3O95983 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3O95983 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3O95983 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3O95983 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3O95983 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3O95983 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3O95983 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3O95983 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3O95983 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3O95983 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD3O95983 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MBD3O95983 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MBD3O95983 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MBD3O95983 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3O95983 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3O95983 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3O95983 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3O95983 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3O95983 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3O95983 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3O95983 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3O95983 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD3O95983 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms