Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX58O95786 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX58O95786 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX58O95786 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX58O95786 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX58O95786 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX58O95786 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX58O95786 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX58O95786 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX58O95786 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX58O95786 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX58O95786 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX58O95786 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX58O95786 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX58O95786 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX58O95786 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX58O95786 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX58O95786 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX58O95786 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX58O95786 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX58O95786 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX58O95786 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX58O95786 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX58O95786 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX58O95786 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX58O95786 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX58O95786 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX58O95786 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX58O95786 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX58O95786 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX58O95786 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX58O95786 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX58O95786 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX58O95786 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX58O95786 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX58O95786 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX58O95786 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX58O95786 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX58O95786 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX58O95786 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX58O95786 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX58O95786 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX58O95786 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX58O95786 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX58O95786 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX58O95786 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX58O95786 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX58O95786 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX58O95786 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX58O95786 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX58O95786 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX58O95786 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX58O95786 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX58O95786 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX58O95786 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX58O95786 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX58O95786 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX58O95786 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX58O95786 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX58O95786 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX58O95786 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX58O95786 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX58O95786 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX58O95786 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX58O95786 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX58O95786 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX58O95786 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX58O95786 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX58O95786 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX58O95786 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX58O95786 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX58O95786 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX58O95786 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX58O95786 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX58O95786 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX58O95786 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX58O95786 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX58O95786 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX58O95786 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms