Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POP4O95707 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POP4O95707 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POP4O95707 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POP4O95707 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POP4O95707 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POP4O95707 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POP4O95707 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POP4O95707 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POP4O95707 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POP4O95707 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POP4O95707 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POP4O95707 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POP4O95707 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POP4O95707 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POP4O95707 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POP4O95707 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POP4O95707 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POP4O95707 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POP4O95707 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POP4O95707 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms