Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR1AO95602 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR1AO95602 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms